먼저 주 독일 베를린 한국 대사관의 영사과에 전화하셔서
Konsularabteilung der Botschaft der Republik Korea
Stülerstr. 8, 10787 Berlin
Tel. : 030 / 26065-432, 433, 434
Fax : 030 / 2606557
E-mail : cons-ge@mofat.go.kr

여권분실에 대해 알려주시고 혹시 여권이 그 곳에 들어왔는지 확인해보세요.
여권분실의 경우, 대부분 우체국을 통해 한국대사관에 보내지게 되어있답니다.
만약 분실된 여권이 오지 않았다면 아마도
가장 먼저 Polizei에 가셔서 도난신고를 하시면
그 곳에서 도난에 대한 진술을 하고난 후, 도난증명서를 써줄겁니다.
그럼 그걸 갖고 다시 외국인관청가셔서 그에 따른 벌금을 내시고
임시 사증 및 도난당한 여권의 신분확인부분의 복사본을 임시로 줄겁니다.
그럼.. 다시 대사관 영사과에 새 여권을 신청해야합니다.
우편으로 신청하시면 아마도 2-3주 정도 걸려 새로운 여권을 발급받게 될 겁니다.
그럼 그걸 갖고 다시 외국인 관청가셔서
다시 비자를 받아야 할겁니다.

예전에 저도 그런 경험이 있어서 어렴풋이 기억해내어 대충 열거해보았습니다.
도움이 조금이나마 되셨기를..