1. 충분히 가능하다고 생각됩니다. 독일은 그 지역에 MPI같은 관련 연구소가 있다던지 하는 경우 등등에 따라 분야마다 강점이 있는 학교들이 조금씩은 다르다고 생각합니다. 일단 그 지역에 관련연구소가 있다면 인턴이나 석사논문을 그 연구소에서 쓸수 있을 확률이 높아지겠죠. 독일에서 상대적으로 유명한 학교에서 공부를 하게된다면 더욱 좋은 환경에서 똑똑한 친구들과 공부할 수 있는 기회가 늘어날 수는 있겠지만 상대적으로 유명하지 않은 대학에서 공부한다고 불이익이 있다고 생각하지는 않습니다. 박사 지원을 위해서는 결국에는 본인 실력이 중요하다고 생각합니다.
2. 불가능할것같지는 않은데 질문자분이 물리과목을 얼마나 들었는지, 수강한 과목을 물리과목으로 얼마나 인정받을수 있는지에 따라 다를 것 같습니다. 이부분은 학교마다 다르기 때문에 이메일이나 전화로 문의하면 답변을 얻을 수 있을겁니다. 어느정도 인정을 받을 수 있다면 학부수업을 어느정도 듣는걸 전제로 조건부 입학은 가능하지 않을까 생각됩니다. 아니면 GRE physics를 요구하는 학교들도 있는데(예를들면 괴팅겐, LMU) 이러한 경우에는 물리 학부과정 졸업에 상응하는 지식이 있다는 걸 증명함으로써 좀 더 수월하게 입학이 가능할 것 같습니다.
잘 준비하셔서 원하시는 결과 얻으시길 바라겠습니다 ^^

1. 네. 충분히 가능합니다.
2. 학교마다, 학과마다 다릅니다.
지원을 희망하시는 전공 홈페이지에서 Studienordnung이나 Zugangsvoraussetzung 문서를 참고하세요. 어떤 학생이 지원이 가능하고 어떤 특정과목을 몇학점 이수해야하는지 등의 조건을 확인 가능합니다.